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      虛擬實驗論文:生化仿真實驗運用探究

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      虛擬實驗論文:生化仿真實驗運用探究

      本文作者:梁亦龍盧利平范歡曾垂省張繼承作者單位:重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院

      驗證性實驗強(qiáng)調(diào)證明科學(xué)事實、概念、理論的活動,通過完整的實驗框架和實驗過程的完成,重新驗證實驗結(jié)果是否達(dá)到原理所描述,目的重在使學(xué)生理解和掌握這個實驗,以達(dá)到熟悉生物相關(guān)原理的目的。一般常規(guī)是通過介紹相關(guān)原理,回顧重要的概念,再介紹實驗步驟分析實驗結(jié)果,提出注意事項,或針對學(xué)生普遍容易出現(xiàn)錯誤的實驗操作進(jìn)行示范,最后引導(dǎo)學(xué)生科學(xué)結(jié)論驗證。

      驗證性虛擬實驗教學(xué)過程

      (1)驗證性虛擬實驗網(wǎng)頁組成驗證性虛擬生物化學(xué)實驗室的網(wǎng)頁頁面由圖1所示。(2)實驗例證基因體外擴(kuò)增技術(shù)(PCR實驗)①原理:先圖示或動畫PCR原理、過程和應(yīng)用,并解釋相關(guān)概念,包括引物、DNA聚合酶、核苷酸、模板等基本概念。②樣品、材料準(zhǔn)備:包括相關(guān)試劑、PCR儀、手套、無菌操作臺、槍、槍頭等,并配上相關(guān)圖片。③PCR擴(kuò)增:包含PCR過程、結(jié)果,用動畫和圖片,充分讓學(xué)生了解其原理和過程。④PCR結(jié)果檢測:對出現(xiàn)的結(jié)果分別進(jìn)行分析。有單一條帶是表明PCR是特異性擴(kuò)增,無條帶可能是什么原因,條帶不單一可能是什么原因,每一結(jié)果都用不同的圖片來顯示給實驗者,讓學(xué)生在虛擬情況下就能分析實驗結(jié)果。用虛擬PCR儀代替?zhèn)鹘y(tǒng)儀器來進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,觀察和分析實驗結(jié)果,結(jié)合實驗圖片或動畫將每個步驟的過程展現(xiàn)給實驗者,把每個步驟中容易出錯的部分給標(biāo)記出來,并對實驗的不同結(jié)果進(jìn)行分析,這樣能有效地幫助學(xué)生理解問題并對錯誤操作有感性認(rèn)識。

      綜合性虛擬實驗教學(xué)組成

      虛擬實驗室也可增加綜合性實驗。在虛擬實驗室中,嘗試用已有的報道的研究資料作為綜合實驗的來源。將生物實驗研究的學(xué)習(xí)置于探究的背景下,將綜合性實驗已有報道看成“問題是什么”,“用何種實驗?zāi)芑卮疬@個問題”,“如何設(shè)計實驗進(jìn)行驗證”,也就是“What?How?Why?”從而重視在探究過程中獲得綜合素質(zhì)的提高,使科學(xué)知識能在不斷的設(shè)問中得到升華。(1)綜合性虛擬實驗網(wǎng)頁組成本實驗室所作的綜合性實驗網(wǎng)頁如圖2所示。其中研究文獻(xiàn)包括本實驗的研究報告及相關(guān)文獻(xiàn)。綜合性實驗還可通過讓學(xué)生自由選題,設(shè)定實驗方案后,利用虛擬儀器進(jìn)行實驗,并作出結(jié)果預(yù)測,從而來提高學(xué)生的創(chuàng)新和科研能力。(2)實驗例證研究干旱對植物抗氧化酶的影響[6]。①寫出本實驗的研究背景,研究目的。首先闡明植物受不良外因影響后,會出現(xiàn)的各種現(xiàn)象。研究干旱地方植物抗旱生理生化狀況,對干旱地方植被恢復(fù)奠定良好的理論基礎(chǔ)。開展植物抗旱的生理抗(耐)性機(jī)理能為植物物種栽培提供依據(jù)。②列出實驗的假設(shè),并據(jù)此設(shè)計實驗過程。植物在不良環(huán)境,會出現(xiàn)相應(yīng)生理生化變化,測定相應(yīng)氣體交換參數(shù),測定相關(guān)的抗氧化酶的活性變化。各種抗氧化酶在生物體中的作用,并分別寫出相關(guān)酶的測定方法。③結(jié)果分析。對不同狀態(tài)下的結(jié)果進(jìn)行分析。④后續(xù)實驗的進(jìn)一步完善。對實驗證明不完善的地方加以分析,并提出完善的方法,運用多種實驗方法加以改進(jìn)研究。本實驗則可以在測定生理生化變化后,進(jìn)一步進(jìn)行基因表達(dá)的研究,檢測不同條件下基因表達(dá)的變化。再將相關(guān)的文獻(xiàn)附上[7-9],即可讓學(xué)生明白研究具體課題的一個基本步驟,為其今后的科研打下良好的實驗基礎(chǔ)。本實驗室的綜合性實驗包括植物的抗氧化酶研究、內(nèi)生菌的抗菌物質(zhì)提取、多糖的抗腫瘤研究等8個實驗。這些實驗,通過選取不同的實驗材料,采用不同的實驗方法,讓學(xué)生對科學(xué)研究的過程有一個深入的了解,能彌補(bǔ)簡單的獨立實驗不足,對學(xué)生今后的更進(jìn)一步的深造打下堅實基礎(chǔ),效果顯著。學(xué)生普遍反映對其生物化學(xué)知識有了深入的了解,并對科研論文有了基本認(rèn)識,提高了學(xué)生畢業(yè)設(shè)計的實驗設(shè)計能力與實際動手能力。

      虛擬實驗視頻

      實驗視頻是通過現(xiàn)場錄制,展示實驗所需儀器、操作過程、實驗要點。通過視頻,教師進(jìn)行詳細(xì)講解并作出示范,可給學(xué)生直觀認(rèn)識,并在視頻中詳細(xì)指出實驗過程中易錯之處,對出現(xiàn)的不同結(jié)果進(jìn)行分析實驗。大型精密儀器也可以在虛擬實驗室中全面展現(xiàn),諸如基因測序儀、細(xì)胞流式儀、核磁共振等。學(xué)生還可掌握生物醫(yī)學(xué)中前沿實驗技術(shù)如酵母雙雜交技術(shù)和蛋白質(zhì)雙向電泳。通過虛擬的過程了解其原理、操作條件、操作過程,在無消耗的情況下可節(jié)省資源、節(jié)約時間、節(jié)省場地,并可加深實驗認(rèn)識,開拓視野,增強(qiáng)學(xué)生的動手能力。

      虛擬實驗反饋

      反饋系統(tǒng)由在線答疑、討論和測試等組成。以BBS的形式為學(xué)生提供答疑和學(xué)習(xí)討論、學(xué)習(xí)心得交流園地,在線測試可根據(jù)每個實驗設(shè)計不同的試題,通過在線提交,并及時反饋實驗信息,并要求學(xué)生提交后續(xù)實驗的設(shè)想。虛擬生物化學(xué)實驗建立在一個虛擬的實驗環(huán)境中,注重的是實驗操作的交互性和實驗結(jié)果的仿真性。它可以有效緩解很多高校在經(jīng)費、場地、儀器等方面面臨的困難和壓力。而且開展網(wǎng)上虛擬實驗教學(xué)能夠改變傳統(tǒng)實驗對時空要求的限制,在任何地點,只需聯(lián)網(wǎng),都可以自由、進(jìn)入虛擬實驗室,操作儀器,進(jìn)行各種實驗[10],有助于提高實驗學(xué)生對實驗掌握,提高教學(xué)質(zhì)量,還可以減輕實驗室管理的壓力,方便異地協(xié)作和資源共享。虛擬實驗室這種教學(xué)方式必將受到愈來愈多得重視和青睞,成為改革實驗教學(xué)手段、強(qiáng)化實驗室建設(shè)的一個重要發(fā)展趨勢。

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